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生物資訊

破解干細(xì)胞的秘密

作者:admin 來源:Cell 發(fā)布時(shí)間: 2014-12-28 22:23  瀏覽次數(shù):
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       在一項(xiàng)開創(chuàng)性研究中,來自歐洲的研究人員組成的一個(gè)研究小組對生長處于純粹未分化狀態(tài)的胚胎干細(xì)胞進(jìn)行了評估。利用新一代測序技術(shù)他們分析了基因的表達(dá)(即轉(zhuǎn)錄組)和染色體修飾(即表觀遺傳學(xué)組)。這一研究發(fā)表在近期的《細(xì)胞》(Cell)雜志上,研究結(jié)果精確地指明了純干細(xì)胞與在實(shí)驗(yàn)室條件下培養(yǎng)的胚胎干細(xì)胞之間的關(guān)鍵差異。

來自荷蘭內(nèi)梅亨大學(xué)的Hendrik G. Stunnenberg博士和英國劍橋大學(xué)Welcome Trust干細(xì)胞研究所胚胎干細(xì)胞專家Austin Smith教授是這項(xiàng)研究的共同領(lǐng)導(dǎo)者。Austin Smith是干細(xì)胞研究領(lǐng)域的權(quán)威人物,現(xiàn)為英國皇家科學(xué)院院士。其在小鼠胚胎干細(xì)胞領(lǐng)域做出一系列杰出的工作,如闡明Oct4在維持胚胎干細(xì)胞多能性中的作用;和山中伸彌同時(shí)發(fā)現(xiàn)Nanog在維持胚胎干細(xì)胞多能性中的作用;闡明Lif/Stat3和BMP/Id通路在維持胚胎干細(xì)胞多能性中的作用;提出多能性的ground state理論并應(yīng)用其首次建立大鼠的胚胎干細(xì)胞系等。

是什么使得胚胎干細(xì)胞維持在多能狀態(tài)?研究人員在一段時(shí)間內(nèi)一直在致力解析這一謎題。現(xiàn)在來自德國、荷蘭和英國的研究人員提供了關(guān)鍵的答案,給予了我們需要知道的關(guān)于細(xì)胞受控機(jī)制及培養(yǎng)最佳途徑的信息。新發(fā)現(xiàn)顛覆了以前研究認(rèn)為的胚胎干細(xì)胞是不穩(wěn)定且隨時(shí)準(zhǔn)備分化的。這一信息有可能幫助推動(dòng)開發(fā)出新的有效治療。

在這篇文章中,研究人員將小鼠胚胎干細(xì)胞分為兩組。一組用血清培養(yǎng),另一組用加入兩種激酶Mek 和GSK3抑制子(稱為“2i”條件)的確定成分培養(yǎng)基培養(yǎng)。后者被假定構(gòu)建出了自然基礎(chǔ)狀態(tài)。研究結(jié)果證實(shí)血清培養(yǎng)ES細(xì)胞相比于2i處理的細(xì)胞在形態(tài)和多能性因子表達(dá)上顯示出更大的異質(zhì)性。研究人員證實(shí)血清和2i培育的ES細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組和表觀遺傳組圖譜存在差異。2i處理細(xì)胞顯示出譜系相關(guān)基因低表達(dá),啟動(dòng)子區(qū)域抑制性組蛋白修飾H3K27me3較少,且具有更少的二價(jià)結(jié)構(gòu)域。然而,血清和2i培育ES也具有一些相似的分化潛力。在2i細(xì)胞中發(fā)育基因的早轉(zhuǎn)錄受到RNA聚合酶II啟動(dòng)子近端暫停(proximal pausing)的抑制。

研究人員表示新研究證實(shí)了轉(zhuǎn)錄組分析可使科學(xué)家們確定細(xì)胞中哪些基因被開啟或關(guān)閉。基因的活性水平也可通過這種方法來計(jì)算。同時(shí),表觀遺傳學(xué)分析為研究人員提供了基因受控機(jī)制的新認(rèn)識(shí)。該研究朝著解開胚胎干細(xì)胞如何維持其多能性的秘密又朝前邁進(jìn)了一步。

通過這項(xiàng)研究,研究人員獲得了尋求構(gòu)建出相當(dāng)于小鼠胚胎干細(xì)胞的新人類多能干細(xì)胞種類的關(guān)鍵參考信息。研究小組表示該數(shù)據(jù)代表了多能性的基態(tài)。

Austin Smith說:“這些研究結(jié)果表明我們現(xiàn)在對于干細(xì)胞的了解到了什么程度。它們也指出了從小鼠分離的真正胚胎干細(xì)胞與當(dāng)前獲得的相對沒那么純且更多變的干細(xì)胞之間的潛在差異。”

 

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