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生物資訊

抗癌向著mRNA開(kāi)炮

作者:admin 來(lái)源:本站 發(fā)布時(shí)間: 2015-04-09 09:22  瀏覽次數(shù):
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lonza 無(wú)血清培養(yǎng)基   (點(diǎn)擊標(biāo)題進(jìn)入) 

 

胚胎冷凍儀(程序降溫儀) (點(diǎn)擊標(biāo)題進(jìn)入)

 

細(xì)胞治療所使用的無(wú)血清培養(yǎng)基  lonza 04-418Q 無(wú)血清培養(yǎng)基 (點(diǎn)擊標(biāo)題進(jìn)入)

 

 

 當(dāng)前大多數(shù)的抗癌藥物都是靶向腫瘤細(xì)胞中的DNA或蛋白質(zhì),而來(lái)自加州大學(xué)伯克利分校的科學(xué)家們?cè)谝豁?xiàng)新研究發(fā)現(xiàn)中揭示出了一套全新的潛在靶點(diǎn):DNA和蛋白質(zhì)之間的RNA中介物。研究結(jié)果發(fā)表在46日的《自然》(Nature)雜志上。

信使RNA(mRNA)是制造蛋白質(zhì)的藍(lán)圖。mRNA在細(xì)胞核中生成,然后穿梭進(jìn)入到細(xì)胞質(zhì)中連接上蛋白質(zhì)生成機(jī)器——核糖體。大多數(shù)科學(xué)家都認(rèn)為,除了獨(dú)特的序列,這些mRNA分子很普通,少有可作為靶向藥物致命靶點(diǎn)的顯著特征。

加州大學(xué)伯克利分校分子和細(xì)胞生物學(xué)教授Jamie Cate,與博士后研究人員Amy LeePhilip Kranzusch發(fā)現(xiàn),有一小組的mRNAs攜帶了獨(dú)特的標(biāo)記,這其中大多數(shù)的mRNAs編碼了與癌癥相關(guān)聯(lián)的蛋白質(zhì)。這些短RNA標(biāo)記結(jié)合了在核糖體處調(diào)控翻譯的eIF3蛋白,這使得結(jié)合位點(diǎn)成為了一個(gè)有前景的靶點(diǎn)。

Cate說(shuō):我們發(fā)現(xiàn)了在基因翻譯為蛋白質(zhì)這一步中,人類(lèi)細(xì)胞控制癌基因表達(dá)的一種新方式。這項(xiàng)研究表明你可以潛在靶向它們的標(biāo)記與eIF3結(jié)合的這些mRNA。這是一些全新的靶點(diǎn),我們可以嘗試生成一些新的小分子來(lái)破壞或是穩(wěn)定這些互作,通過(guò)這樣的方式來(lái)控制細(xì)胞的生長(zhǎng)。

在細(xì)胞的1萬(wàn)多種mRNAs中占據(jù)不到500種,這些標(biāo)記mRNAs似乎非常特別,它們攜帶了有關(guān)一些特異蛋白質(zhì)的信息,在細(xì)胞中這些蛋白質(zhì)的水平必須維持精細(xì)平衡,才能避免細(xì)胞生長(zhǎng)之類(lèi)的過(guò)程陷入超速,這有可能會(huì)導(dǎo)致癌癥。

令人驚訝的是,其中的一些標(biāo)記開(kāi)啟了mRNA翻譯為蛋白質(zhì)的過(guò)程,而另一些則關(guān)閉了這一過(guò)程。

Cate說(shuō):我們的新研究結(jié)果表明,在蛋白質(zhì)生成前一些關(guān)鍵的致癌基因受到了抑制。這一從前未知的新控制步驟可以作為新抗癌藥物的一個(gè)極好的靶標(biāo)。

另一方面,一些開(kāi)啟翻譯的的標(biāo)記激活了當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)過(guò)量表達(dá)時(shí)會(huì)致癌的一些基因。也可以采用一些新的抗癌藥物來(lái)靶向這些標(biāo)記阻斷這一激活過(guò)程。

mRNADNA和核糖體之間的信使

我們的基因定位在細(xì)胞核中,而生成蛋白質(zhì)的機(jī)器則存在于細(xì)胞質(zhì)中,mRNA是兩者之間的信使。所有的基因DNA被轉(zhuǎn)錄為RNA,然后再剪除掉一些無(wú)功能的片段就生成了mRNAmRNA隨后從細(xì)胞核中出來(lái)穿梭進(jìn)入到細(xì)胞質(zhì)中,在那里一個(gè)起始復(fù)合物會(huì)附著到mRNA上,護(hù)送它到達(dá)核糖體處。核糖體讀取mRNA中的核酸序列,吐出氨基酸序列:即蛋白質(zhì)(延伸閱讀:Cell揭示遺傳密碼中的隱秘信息 )

Cate 說(shuō):細(xì)胞知道何時(shí)何地啟動(dòng)蛋白質(zhì)合成,如果細(xì)胞的這一能力出現(xiàn)異常,你將有罹患癌癥的風(fēng)險(xiǎn),因?yàn)槟愕牡鞍踪|(zhì)合成會(huì)失去控制。蛋白質(zhì)會(huì)在不應(yīng)該的時(shí)候活化,過(guò)度刺激細(xì)胞。

eIF3蛋白是這一起始復(fù)合物的一個(gè)組成元件,它自身是由13個(gè)蛋白質(zhì)亞基構(gòu)成。人們已經(jīng)知道,除了穩(wěn)定起始復(fù)合物的結(jié)構(gòu),eIF3還調(diào)控了mRNA翻譯為蛋白質(zhì)的過(guò)程。eIF3過(guò)表達(dá)也與一些乳腺癌、前列腺癌和食道癌相關(guān)聯(lián)。

Lee說(shuō):由于eIF3包含了一個(gè)大蛋白質(zhì)復(fù)合物,我認(rèn)為它能夠驅(qū)動(dòng)多種功能。這項(xiàng)研究著實(shí)強(qiáng)調(diào)了它并非只是一個(gè)支架因子,還是一個(gè)翻譯的主控因子。

Lee將目標(biāo)對(duì)準(zhǔn)了結(jié)合eIF3mRNAs,找到一種方法在典型人類(lèi)細(xì)胞的1萬(wàn)多種mRNAs中篩選出了它們,并測(cè)序了整套mRNAs尋找了eIF3的結(jié)合位點(diǎn)。她發(fā)現(xiàn)479mRNAS(約占細(xì)胞中3%mRNAs)結(jié)合了eIF3,其中許多似乎在細(xì)胞中發(fā)揮了相似的作用。

Lee說(shuō):當(dāng)我們檢測(cè)這些mRNAs的生物學(xué)功能時(shí),我們看到焦點(diǎn)集中在一些癌癥中失調(diào)的過(guò)程上。這些過(guò)程涉及了細(xì)胞周期、細(xì)胞骨架、程序性死亡(凋亡),以及細(xì)胞生長(zhǎng)和分化。

從治療上看,人們可以篩查癌組織中的eIF3表達(dá)增高情況,然后靶向我們鑒別的受到eIF3調(diào)控的一些信號(hào)通路。

事實(shí)上,Lee證實(shí)了她可以調(diào)整兩個(gè)癌癥相關(guān)基因的mRNA,來(lái)阻止細(xì)胞變得具有侵襲性。這兩個(gè)基因都控制了細(xì)胞生長(zhǎng)。

Cate說(shuō):我們證實(shí),我們可以通過(guò)操控這些互作抑制侵襲性生長(zhǎng),因此顯然這為通向另一個(gè)層次的潛在抗癌療法,靶向這些RNA結(jié)合區(qū)域開(kāi)啟了大門(mén)。

原文標(biāo)題:eIF3 targets cell-proliferation messenger RNAs for translational activation or repression

原文摘要:Regulation of protein synthesis is fundamental for all aspects of eukaryotic biology by controlling development, homeostasis and stress responses1, 2. The 13-subunit, 800-kilodalton eukaryotic initiation factor 3 (eIF3) organizes initiation factor and ribosome interactions required for productive translation3. However, current understanding of eIF3 function does not explain genetic evidence correlating eIF3 deregulation with tissue-specific cancers and developmental defects4. Here we report the genome-wide discovery of human transcripts that interact with eIF3 using photoactivatable ribonucleoside-enhanced crosslinking and immunoprecipitation (PAR-CLIP)5. eIF3 binds to a highly specific program of messenger RNAs involved in cell growth control processes, including cell cycling, differentiation and apoptosis, via the mRNA 5′ untranslated region. Surprisingly, functional analysis of the interaction between eIF3 and two mRNAs encoding the cell proliferation regulators c-JUN and BTG1 reveals that eIF3 uses different modes of RNA stem–loop binding to exert either translational activation or repression. Our findings illuminate a new role for eIF3 in governing a specialized repertoire of gene expression and suggest that binding of eIF3 to specific mRNAs could be targeted to control carcinogenesis. 

 

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