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生物資訊

如何選擇低溫凍存保護(hù)劑

作者:bitebo 來源:本站 發(fā)布時(shí)間: 2017-11-27 17:43  瀏覽次數(shù):
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前言

由于處理和存儲(chǔ)樣品的變化會(huì)影響研究結(jié)果,因此要想維持在現(xiàn)場收集樣品的完整性也是微生物研究中的一項(xiàng)重大挑戰(zhàn)。 即使是微生物菌群最小的變化或者相對(duì)豐度改變,也會(huì)極大的干擾群體比對(duì),因此儲(chǔ)存方法引起的變化越小越好。

如果只是分析核酸組成,就這種類型的研究而言,在儲(chǔ)存樣品前可以將其加入到一種裂解緩沖液中。目前的證明表明,低溫凍存保護(hù)劑會(huì)在不同程度上影響不同微生物物種的構(gòu)成。

 

DMSO + Trehalose & Tryptic Soy Broth

“關(guān)鍵在于選擇一種可靠,并且適合你的研究的方法,同時(shí)也要注意到其潛在的誤差”。

在比較儲(chǔ)存樣品和新鮮樣品中的微生物組成之前,可以采用一種快速的方法,來評(píng)估保護(hù)劑的作用,那就是檢測一下樣品DNA的量,“如果DNA量不足,那么你采用的方法也許并不適用于這種微生物的保存。”

 

DMSO + Trehalose & Tryptic Soy Broth

 

混合溶劑:二甲基亞砜(DMSO)與海藻糖,胰酶大豆肉湯(Tryptic Soy BrothTSB),這能用于保持三種不同微生物組系統(tǒng)冷凍樣品的保真性。

 

“海藻糖能防止細(xì)胞干燥,TSB也是一種低溫凍存保存劑,”建議在將這一溶液加入到樣品中之前,先放置到4°C中,然后再與樣品混合,保存到超低溫冰箱里去。“如果無法放到−80°C冰箱,那么也可以用家用冰箱,但是樣品要盡可能早的凍存,而且需要加入低溫凍存保護(hù)劑。”該凍存方法參考:Scientist雜志


二甲基亞砜(DMSO)屬于非質(zhì)子極性溶劑,常用于化學(xué)反應(yīng)、PCR反應(yīng)的助溶劑,特別是超長PCR反應(yīng),提高得率。MP Biomedicals DMSO可用于細(xì)胞、組織和器官的冷凍保護(hù)劑,保護(hù)細(xì)胞免受冰晶引起的機(jī)械性損傷;可用于原代、傳代培養(yǎng)的細(xì)胞,重組細(xì)胞,雜交瘤細(xì)胞,胚胎干細(xì)胞、造血干細(xì)胞的凍存;另外,可作為有機(jī)和無機(jī)化合物的溶劑,包括脂肪、碳水化合物、染料、樹脂、和聚合物。

 

產(chǎn)品參數(shù)

 

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