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生物資訊

關(guān)于慢病毒轉(zhuǎn)導(dǎo)的那些事

作者:admin 來源:本站 發(fā)布時間: 2019-03-23 14:18  瀏覽次數(shù):
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慢病毒

 

利用病毒傳遞系統(tǒng)來轉(zhuǎn)導(dǎo)細(xì)胞在基因和蛋白質(zhì)研究已變得很常見,慢病毒載體就可以穩(wěn)定地表達(dá)目的基因。

 

慢病毒,屬于逆轉(zhuǎn)錄病毒,它的主要作用機(jī)制是表達(dá)逆轉(zhuǎn)錄酶,將病毒RNA轉(zhuǎn)化為雙鏈DNA,整合酶再將病毒DNA插入宿主DNA,然后和宿主細(xì)胞一起進(jìn)行分裂。

 

慢病毒可以感染分裂細(xì)胞和非分裂細(xì)胞,如有絲分裂后的細(xì)胞。

 

 概述

 

 

我們都知道,病毒缺乏復(fù)制機(jī)制,所以需要細(xì)胞來“存活”。慢病毒載體傳遞系統(tǒng)最重要的一個方面就是慢病毒載體的生產(chǎn),通常在HEK293細(xì)胞(或一些變種)。

 

例如,慢病毒傳遞系統(tǒng)的一個常見用途是插入短的發(fā)夾RNAs (shRNA),用于RNAi介導(dǎo)的基因敲除。

 

 



shRNA首先被包裝成慢病毒載體,然后轉(zhuǎn)染HEK293細(xì)胞。轉(zhuǎn)染的細(xì)胞孵育約3天,此間慢病毒復(fù)制和產(chǎn)生慢病毒顆粒,然后收獲,評價滴度,再轉(zhuǎn)化目標(biāo)細(xì)胞。

 

 

 

 關(guān)于轉(zhuǎn)染HEK293細(xì)胞

維持細(xì)胞的良好狀態(tài)是必要的。HEK293細(xì)胞生長迅速,胰蛋白酶化速度快,所以不要在胰蛋白酶中長時間孵育,否則可能會有大量細(xì)胞死亡。

 

解凍后的細(xì)胞應(yīng)至少傳代兩次,然后接種進(jìn)行轉(zhuǎn)導(dǎo)實驗。并且要非常輕柔地處理,因為細(xì)胞很容易分離。

 

在轉(zhuǎn)染實驗中,HEK293細(xì)胞接種于約5*10^6細(xì)胞/10cm培養(yǎng)皿中,接種后次日細(xì)胞約40-50%融合。

 

 為轉(zhuǎn)導(dǎo)做好準(zhǔn)備

將慢病毒載體質(zhì)粒連同病毒包裝載體打包成脂質(zhì)體,并將其遞送到HEK293細(xì)胞中。

 

在實驗的包裝部分使用無血清培養(yǎng)基是非常重要的。無血清培養(yǎng)基促進(jìn)DNA與陽離子脂質(zhì)體復(fù)合物的形成,提高轉(zhuǎn)染效率。

 

 



有了轉(zhuǎn)染復(fù)合物,含shRNA、包裝質(zhì)粒和脂質(zhì)體,就可以進(jìn)行包裝了。傾斜帶有HEK293細(xì)胞的培養(yǎng)皿,將轉(zhuǎn)染混合物逐漸加入收集的培養(yǎng)基中。

 

 



在添加轉(zhuǎn)染混合物時要謹(jǐn)慎,溫柔操作。一旦加入溶液,小心地旋轉(zhuǎn)平板,使培養(yǎng)基混合,將轉(zhuǎn)染混合物均勻地分配到細(xì)胞上。在無血清培養(yǎng)基中培養(yǎng)5-8小時。

 

孵育后,輕輕抽吸培養(yǎng)基(這將包含沒有轉(zhuǎn)染HEK293細(xì)胞的含有質(zhì)粒的脂質(zhì)體),并在培養(yǎng)皿的一側(cè)加入10 ml完全培養(yǎng)基,這樣細(xì)胞就不會分離。HEK293細(xì)胞將shRNA包裹成病毒顆粒并釋放到培養(yǎng)基中。 

 

此時,培養(yǎng)基中會充滿病毒顆粒,因此在搬運(yùn)時應(yīng)穿戴適當(dāng)?shù)姆雷o(hù)用品。


48小時后收集培養(yǎng)基(病毒顆粒),將10 ml新鮮的完全培養(yǎng)基加入同一培養(yǎng)皿中。72小時后再次收集培養(yǎng)基,與48小時收集的結(jié)合。


通過0.45微米的過濾器對收集到的混合培養(yǎng)基進(jìn)行消毒,以允許病毒通過。凍融循環(huán)會降低病毒的效力,所以最好進(jìn)行分裝。


病毒可以在4℃下保存一到兩個月,長期保存在-20℃。經(jīng)常使用漂白劑處理在病毒產(chǎn)生過程中使用的吸管頭和平板。

 

 病毒進(jìn)入細(xì)胞

通常,測定病毒的效價非常重要,方便確定實驗濃度。一個良好的敲除,至少50%的細(xì)胞轉(zhuǎn)導(dǎo)病毒。用適當(dāng)?shù)姆治龇椒z查細(xì)胞是否定點敲除,通常涉及到Western Blot。


1.使用相同比例的病毒和細(xì)胞獲得50%的轉(zhuǎn)導(dǎo)。在一個15ml的試管中,用5ml的完全培養(yǎng)基重懸約200萬個細(xì)胞(10cm培養(yǎng)皿的四分之一)。

 

 



在同一試管中,加入2.5ml病毒和15ug/ml的聚凝胺。聚凝胺通過中和病毒顆粒和細(xì)胞膜之間的電荷來提高轉(zhuǎn)導(dǎo)效率。

 

 

 



2.輕輕混勻,將細(xì)胞放入一個10cm的新培養(yǎng)皿中。24小時后,換到?jīng)]有病毒的新鮮完全培養(yǎng)基中。

 

 



如果shRNA構(gòu)建物含有熒光標(biāo)記物,可以檢測轉(zhuǎn)染48小時后檢測是否整合成功;如果沒有,繼續(xù)進(jìn)行抗生素選擇48小時。


 

  

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