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細胞角蛋白7（CK7）分子量為54KDa，主要標記腺上皮和移行上皮，卵巢，肺和乳腺上皮CK7陽性，而結腸、前列腺和胃腸道上皮為CK7陰性，因此可用于肺癌（CK7+）與結腸癌（CK7-）的鑒別。

 

細胞角蛋白20（CK20）的分子量為46KDa，主要標記胃腸道上皮、尿道上皮和Merkel細胞。主要用于胃腸道腺癌、卵巢黏液性腫瘤，Merkel細胞癌的診斷。鱗癌、乳腺癌、肺癌、

子宮內膜癌和卵巢非黏液性腫瘤均不表達CK20。

 

高分子量角蛋白抗體表達于鱗狀上皮、導管上皮、和其他復層上皮。是前列腺基底細胞癌的特異性標記物，多與P53聯合顯示前列腺基底細胞以協助前列腺的診斷，還可用鑒別乳腺導管及小葉上皮來源的腫瘤。

 

低分子量角蛋白幾乎可以標記所有非鱗狀上皮，尤其各種單層管狀腺上皮，在鱗狀上皮中不表達。在腫瘤中LCK可以特異性的標記非鱗狀上皮發生的腫瘤。標記卵巢腺癌、胃腸道腺癌、甲狀腺癌和絕多數導管癌。尤其對乳腺、胰腺、膽管和延腺上皮發生的腫瘤、內分泌器官腫瘤（癌和腺瘤）、肝癌、子宮內膜癌、腎癌、神經內分泌腫瘤等腫瘤顯著性的陽性標記。膀胱移行細胞癌、鼻咽癌、胸腺瘤、間皮瘤也呈陽性反應。絕大多數鱗癌陰性。

 

廣譜細胞角蛋白（AE1/AE3）主要標記角化上皮、復層鱗狀上皮、復層上皮、增生的角化上皮和單層上皮，用于鱗癌（包括梭形變異），各種腺癌（包括腎上腺癌、肝細胞癌）、移行上皮癌，小細胞癌，惡性間皮瘤、生殖細胞腫瘤（除外精原細胞瘤），部分滑膜肉瘤、平滑肌肉瘤可以陽性標記。在鑒別診斷中可以聯合EMA和CEA等指標進行上皮性腫瘤與非上皮性腫瘤的鑒別診斷，也可以用于各種癌的研究。

 

EMA是一組糖蛋白，廣泛分布在各種正常上皮細胞膜上及其腫瘤中，分布范圍與細胞角蛋白相似，但對內臟腺上皮的表達優于細胞角蛋白。因此對上皮源性腫瘤，尤其是低分化腺癌，最好與細胞角蛋白聯合運用，可提高陽性率。

 

細胞角蛋白10(CK10)分子量為56.5 KDa，主要標記上皮的基底上皮和顆粒層細胞，同時CK10與細胞的分化程度呈正比，高分化者常陽性，主要用于鱗癌的診斷。

 

細胞角蛋白（CK18）的分子量為45KDa，屬于低分子量A型細胞角蛋白，主要標記各種單層上皮包括腺上皮，而復層鱗狀上皮常為陽性，主要用于腺癌的診斷。

 

CEA是一種在胎兒腸道產生的癌胚抗原，在成人結腸的正常粘膜上皮和其他組織中也有極低的表達，在胃腸道腺癌（包括胰腺癌），肺腺癌和甲狀腺髓樣癌中高表達，只要用于標記上皮性腫瘤，尤其是腺上皮來源的腺癌，僅識別不典型增生和癌變組織的CEA。

 

CgA是人類腎上腺髓質中含量最高的一種可溶性酸性蛋白，廣泛存在于神經元及其神經內分泌細胞和腫瘤細胞中，主要用于神經內分泌腫瘤如：垂體腫瘤，胰島細胞瘤，噬絡細胞瘤，甲狀腺髓樣癌、小細胞肺癌、類癌的診斷。

 

絨毛蛋白是一種分子量為95KD的細胞骨架蛋白，正常分布在腸上皮和腎近曲小管上皮，可用于腸上皮來源腫瘤和非腸上皮腫瘤的鑒別診斷，亦可作為胃腸道神經內分泌診斷地重要指標。

 

CD3對早期的T細胞有較高的特異性，對B細胞不表達，主要用于T細胞淋巴瘤的診斷。，

 

 

CD43主要標記T細胞，表達在正常T淋巴細胞、髓細胞、巨嗜細胞和漿細胞中，正常B細胞或反應性B細胞CD34(-)；CD43在各種淋巴細胞造血腫瘤中表達復雜，90％的T淋巴細胞淋巴瘤CD43(+),30%低級別的B細胞淋巴瘤CD43(+),69%的急性B淋巴細胞性白血病CD43(+),97%的急性T淋巴細胞性白血病CD43(+),44%間變性大細胞淋巴瘤CD43(+),所有髓外骨髓瘤/粒細胞肉瘤CD43(+)，和部分骨髓瘤CD43陽性。常與其他T細胞標記物如CD3和CD45RO聯合檢測，用于T細胞淋巴瘤的輔助診斷。

 

CD5主要分布在胸腺細胞（95％）和外周血的淋巴細胞（72％），正常淋巴結中，CD5主要分布在T細胞區，主要用于T細胞白血病、T細胞淋巴瘤的輔助診斷。外套層細胞淋巴瘤常常以CD5陽性表達，而濾泡中心性淋巴瘤常為陰性。

 

CD20重要分布在B細胞，前B細胞后期和漿細胞之前的B細胞，一般不與T細胞呈交叉反應。對B細胞淋巴瘤和急慢性淋巴細胞白血病等有較好的細胞特異性，因此在惡性淋巴瘤尤其是T細胞或B細胞淋巴瘤的分類上,CD20是最常用的B細胞標記。

 

CD79a是B細胞的廣譜標記物，從前B開始到成熟的漿細胞都可以標記。CD79a向B細胞末端分化調節過程中會與CD79b有部分免疫反應交叉。97％的B細胞淋巴瘤CD79a(+),前B細胞急性淋巴細胞白血病（ALL）CD79a(+)，急性T細胞淋巴細胞白血病CD79a(-),罕見表達。CD97a是B細胞常用標記物。

 

白細胞共同抗原是五種或更多的高分子量糖蛋白組成的蛋白家族，主要位于白細胞表面，包括T、B淋巴細胞、多形核白細胞、單核細胞等，而在紅細胞、血小板及非造血系統中不表達。因此是區別淋巴瘤/白血病和非造血組織腫瘤（如未分化細胞癌、小圓細胞肉瘤）的特異性標記物。此抗體主要用于淋巴瘤和未分化小細胞癌的鑒別診斷。

 

CD34是一種一種分子量110KDa的單鏈穿膜蛋白，主要標記造血干細胞髓樣細胞和血管內皮細胞。可見識別內皮細胞分化，但識別血管的敏感性與腫瘤的分級無關。85%以上的血管肉瘤和Kapios肉瘤的CD34表達陽性；與CD117聯合應用與鑒別胃間質瘤的診斷：一般在孤立性纖維瘤中CD34（＋）可以與CD34（－）鑒別；和皮膚隆起性纖維肉瘤CD34(+),良性纖維組織細胞瘤CD34(-)；乳腺中梭形細胞癌CD34(-)與惡性葉狀瘤CD34(+)的鑒別。

 

MC主要分布于間皮細胞中，其他腺上皮一般不表達，主要用于惡性間皮瘤的診斷。在鑒別診斷時，惡性間皮瘤的MC陽性部位應為胞膜，而其他腺癌多為胞漿陽性。

 

TAG-72是一種分子量大于1，000KDa的黏液蛋白，除分泌腺上皮外，其他正常上皮一般不表達。主要用于結腸癌、胃癌、胰腺癌、卵巢癌、內膜癌和肺癌的研究。亦可用于肺癌（TAG-72+）和惡性間皮瘤（TAG-72-）的鑒別診斷。

 

TTF-1是一種分子量為38－40KD的核蛋白，在胎兒肺組織和成人2型肺泡上皮中存在，而在1型肺泡上皮中始終不表達，TTF-1在成人組織中主要分布在內胚層分化的甲狀腺濾泡細胞，間腦局部和呼吸道上皮中。主要用于肺小細胞癌的診斷、肺原發性腺癌與轉移性腺癌的鑒別診斷，以及肺癌與胸膜惡性間皮瘤、副節瘤的鑒別診斷。常與CSDX2、CK20、CK7、

Villin的聯合應用。在肝細胞和肝細胞腫瘤中為漿表現，可以用于鑒別原發性和轉移性肝腫瘤。

 

S-100是一種可溶性酸性蛋白。有三種亞型。S-100主要存在于神經組織、垂體、頸動脈體、腎上腺髓質、唾液腺、少數間葉組織，主要用于星型細胞少數膠質瘤、室管膜瘤、神經母細胞瘤、神經鞘瘤、惡黑、脂肪肉瘤的診斷與鑒別診斷。

 

SCLC被認為神經黏附分子糖蛋白，主要用于肺小細胞癌的診斷和神經源性腫瘤如神經母細胞瘤、膠質瘤和黑色素瘤的研究。

 

Syn是一種糖蛋白，存在于神經元突觸前囊泡膜上、腎上腺髓質細胞和神經內分泌細胞的胞漿內，主要用于噬珞細胞瘤、節細胞神經瘤、副節瘤以及AUPD系統腫瘤的診斷和鑒別診斷。

 

 Desmin為中間絲蛋白之一，正常分布于平滑肌細胞、心肌細胞、骨骼肌細胞和肌上皮細胞及其腫瘤中，主要用于子宮、皮膚、胃腸道及其其他橫紋肌肉瘤和肌上皮瘤的診斷和鑒別診斷。

 

肌動蛋白是一種具有收縮能力的的微動蛋白，廣泛分布于幾乎所有的肌型蛋白中。Actin是一種廣譜肌動蛋白，主要用于檢測骨骼肌、平滑肌、血管平滑肌、心肌和肌源性腫瘤包括平滑肌瘤、平滑肌肉瘤和橫紋肌肉瘤以及肌上皮細胞和肌上皮瘤等。

 

Ki-67與PCNA一樣，主要用于判斷細胞增殖的活性，表達在所有活動的細胞周期（G1,S,G2和有絲分裂期中），而在G0期不表達。臨床資料表明Ki-67增殖指數高低與許多腫瘤 的分化程度、浸潤轉移以及預后密切相關。因此也是某些惡性腫瘤的預后重要參考指標之一。

 

P53是一種抑癌基因，有野生型和突變型兩種亞型。免疫組化所檢測的主要為突變型P53,主要用于各種惡性腫瘤的研究，可作為一種預后指標。P53陽性者說明預后不良，同時可作為細胞凋亡中的一個調控因子。

 

PCNA是和細胞周期相關的36KD的核蛋白，是細胞DNA合成所必需的蛋白。此抗體和所有脊椎動物、昆蟲的PCNA反應，表達于增值細胞S期、G1期和G2初期。作為細胞增殖指數的主要標記物，用于研究惡性腫瘤的細胞增殖和判斷其惡性度，對腫瘤的治療及預后的判斷有一定的意義。

 

是GST家族中一種主要的同工酶，具有解毒功能。目前認為是腫瘤細胞產生耐藥的一種標記，所介導的抗癌藥物為順鉑等。可用于許多惡性腫瘤如肝癌、胃癌、結腸癌、胰腺癌、食管癌的研究。

 

LRP是一種分子量為104－110KD的蛋白，亦屬多藥耐藥（MDR）中一種表型，可表達于許多腫瘤組織中，陽性者預示對化療不敏感，主要用于各種惡性腫瘤的研究。