答：各種常用方法的優(yōu)缺點如下：
(1)化學合成dsRNA：優(yōu)點：快捷，通常6－8天內(nèi)就可以從供應商處拿到定制的RNA oligo。
(2)體外轉錄dsRNA：優(yōu)點：價格相對低廉。缺點：操作困難、耗時。
(3)PCR制備編碼shRNA的轉錄DNAs：優(yōu)點：經(jīng)濟，較快捷。缺點：這種dsDNA導入細胞有一定難度。
(4)shRNA表達質粒：優(yōu)點：基因干擾效果持久，經(jīng)濟；缺點：制備耗時；導入效率較低下；還涉及質粒在細胞內(nèi)的定位、shRNA體內(nèi)折疊效率，非特異性基因抑制等。

問:siRNA設計的時候應該注意什么？

　答：siRNA設計是一個需要由軟件完成的工作，但其中也有一般規(guī)律可尋： 1.起始密碼子75-100個以后，終止密碼子100個以前的片斷 2.GC比例在35-50之間，最好不要超過55% 3.設計好的序列必須進行blast同源分析。需要提醒的是，對于任一個靶基因，RNAi的選擇都帶有一定的隨機性。

問：應該使用什么溶劑溶解RNA，水還是緩沖液？
推薦使用1xTE緩沖液（在無RNase的條件下配制 10 mM TrisCl, pH7.5, 0.1 mM EDTA）溶解單鏈RNA，這將緩沖pH和鰲合金屬離子，減少RNA的降解。也可以使用無RNase水，雙鏈的RNA凍干自10 mM Tris-HCL, pH 8.0, 20 mM NaCl, 1 mM EDTA，再次懸浮在適量的水中，RNA濃度到20μm，將恢復到相同的緩沖液。

問：如何在RNA oligo的OD、 nmol和質量間進行換算的？

　答：RNA oligo的OD、 nmol和質量間有精確的公式可以計算，但一般情況下，對于一個21 bp 的siRNA oligo，有如下簡單關系：1 OD duplex＝3 nmols＝40ug

　答：現(xiàn)在市場上銷售的RNA干擾產(chǎn)品雖然很多，但大體可以分為兩類，一類是化學合成的RNA oligo；另一類是依托于分子生物學操作的試劑盒。這兩類產(chǎn)品目前都廣泛用于RNA干擾研究。作為剛剛進入RNA干擾研究的用戶，比較好的研究路線是先針對你要研究的基因，合成一個由4～5對RNA oligo組成的一個RNA oligo 組，用這組RNA oligo篩選出具有明確基因下調作用的特定RNA oligo。下一步，可以根據(jù)您的研究需要，選擇使用載體或者使用合成相對大量的RNA oligo。一般情況下，如果后繼研究希望通過觀察基因持續(xù)下調研究基因功能，你需要選擇穩(wěn)定表達的載體系統(tǒng)；如果后繼研究希望觀察一個RNA 干擾片段作為藥物的作用和作用結果，就需要合成較大量的RNA oligo。