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生物知識

土壤DNA抽提試劑盒使用說明書

作者:admin 來源:本站 發布時間: 2015-09-17 22:15  瀏覽次數:
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1.Weigh 500 mg of glass beads in a 15 ml centrifuge tube, add 0.2-0.5 g soil sample. Add 1 ml Buffer SLX Mlus. Vortex at maximum speed for 3-5 minute to lyse sample. For the best result, A Mixer Mill,such as Fastprep-24,Mixer Mill 300, should be used.
稱取500毫克的玻璃珠在15毫升離心管,添加0.2 -0.5 g土壤樣品。加入1毫升SLX Mlus緩沖液。最大速度下攪拌3 - 5分鐘直到樣品溶解。為達到最佳效果,需要用到攪拌磨,如Fastprep-24、Mixer Mill 300。

2.Add 100 ul Buffer DS and vortex to mix.
加入100ulDS緩沖液,攪拌混勻

3.Incubate at 70 ℃ for 10 minute. Briefly vortex the tube once during the incubation. For some difficult lysis bacterial. Increase the temperature to 90 .
70 ℃ 培養10分鐘。在培養的過程中稍微地攪拌離心管一次,對一些比較難溶解的細菌,將溫度調至90℃。

4.Centrifuge at 3000 rpm for 3 min at room temperature. Transfer 800 ul the supernatant into a new 2 ml tube and add 270 ul Buffer SP2. 
Mix the sample throughly by vortexing.室溫下3000rpm離心3分鐘。轉移800ul上清液到一個新的2 ml 管,然后加入270 ul SP2 緩沖液。攪拌,徹底地混勻樣品。

5.Incubate in ice for 5 min. Centrifuge at full speed (13,000 ×g) in a microcentrifuge  for 5 min at 4 .
冰上孵育5分鐘。在微離心機下,4℃全速(13,000 g)離心5分鐘。

6.Carefully transfer supernatant to a new 2 ml tube and add 0.7 volume of isopropanol. Mix throughly by inverting tube for 20 -30 times. If the soil contains very low DNA, incubate the sample at -20℃ for 1 hour.
小心地轉移上清液到一個新的 2 ml 管,然后加0.7體積的異丙醇。通過反向管徹底地混合20-30次。假如土壤中含少量的DNA,需要在-20℃ 孵育1h

7.Precipitate DNA by centrifuge at full speed (13,000 ×g) for 10 minute at 4 ℃ 
℃下全速(13,000 ×g)離心10分鐘,沉淀DNA

8.Carefully discard the supernatant and make sure not dislodge the DNA pellet. Invert the tube on a absorbent paper for 1 minute to drain the liquid. It is not necessary to dry the DNA pellet.小心地棄掉上清液,確保不攪動DNA沉淀。倒置離心管在吸水紙上分鐘,使液體流盡。不需要干燥DNA沉淀。

9.Add 200 ul of Elution Buffer to the tube and vortex for 10 seconds.Incubate at 65℃ for 10- 20 minutes to dissolve the DNA pellet.加 200 ul 洗脫緩沖液,然后攪拌10秒鐘。在 65℃ 孵育10-20 分鐘,溶解DNA 沉淀。

10.Add 50 -100 ul of HTR Reagent. Mix throughly by vortexing for 10 minute. Note :completely resuspend HRT Reagent by shaking the bottle before use. 
加 50- 100ul HTR 試劑,攪拌10分鐘,徹底混勻。注意:用前搖動瓶子,充分懸浮HTR 試劑。
11.Incubate at room temperature for 2 minutes. Centrifuge at full speed (13,000 ×g) for 2 minutes.室溫下孵育2分鐘。全速 (13,000 ×g)離心2分鐘。

12.Transfer cleared supernatant to a new2 ml tube.Note :if supernatant still have dark color from soil ,perform the HTR treatment again by repeat step 10-12.
轉移清澈的上清液到一個新的2ml管。注意:假如上清液呈黑色,重復10-12步。

13. Add  equal volume of XP2 Buffer ,mix by vortexing. For examper: if the sample from step 12 is 250 ul, add 250 ul Buffer XP2.
加入等量的XP2 緩沖液,攪動混勻。如:12步后的量是250ul,就加入250ulXP2緩沖液。
14.Apply the sample from step 13 to a HiBind DNA Column assembled in a 2 ml collection tube(supplied).centrifuge at 10,000×g for 1 minute at room temperature. Discard flow-through liquid and re-use collection tube.
13步的樣加到組裝于2ml收集管(已提供)的HiBind DNA Column室溫下10,000×離心1分鐘,倒掉直流液體,再次使用收集管。
15.Place the column into the same 2 ml collection tube from previous step and add 300 ul XP2 Buffer. Centrifuge at 10,000×g for 1 minute. Discard the flow-through and collection tube.將柱子放到相同的先前的2ml收集管,然后加入3000ulXP2緩沖液。10,000×g離心1分鐘。棄掉液體和收集管。
16.Place column into a new 2 ml collection tube(supplied) and wash by adding 700 ul SPW Wash Buffer diluted with absolute ethanol. Centrifuge at 10,000×g for 1 minute.Discard flow-through liquid and re-use collection tube in next step.Note:SPW Wash Buffer is provided as a concentrate and must bediluted with absolute ethanol as indicated on the bottle and page 4.  
將柱子置于一個新的2ml收集管(已提供),加入700ul 用無水乙醇稀釋的SPW洗脫液洗脫。10,000×g離心1分鐘。棄掉直流液,收集管下一步再次使用。注意:SPW洗脫液必須濃縮,必須用無水乙醇再次稀釋,此項注明在瓶子上和第4頁。
17.Repeat step 16 with a second 700 ul SPW Wash Buffer.
重復16步。
18.Discard liquid and re-insert the column to the empty collection tube,centrifuge the column at full speed(13,000 ×g) for 2 minutes at room temperature. This step is critical in removing traces of ethanol that will interfere with downstream applications.
棄掉液體,重新插入柱子到空的收集管,室溫下全速離心2分鐘。這步對清除乙醇痕跡很重要。因為乙醇會干擾下面步驟的應用。
19.Place column into a clean 1.5 ml microcentrifuge tube (not supplied). Add 30- 100 ul Elution Buffer directly onto the centre of HiBind matrix. Incubate at 65 ℃ for 10-15 minutes.
將柱子置于一個干凈的1.5ml的微離心機管(沒有提供)。直接加入30-100ul洗脫液在HiBind matrix的中心。65 ℃下孵育10-15分鐘。
20.Centrifuge at full speed (13,000 ×g) for 1 min to Elute DNA.
全速離心1分鐘,洗提DNA
21.Repeat elution step 19-20 with a second 30-100 ul Elution Buffer.
重復洗脫步驟19-20

 

 

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